疾病是与健康相对而言，在一定的条件下机体与病因相互作用产生的损伤与抗损伤的复杂的斗争过程，与体内、体外环境的变化密不可分。外部环境如：气候的变化、工业污染、植被的破坏、湿地的改变、雾霾等；内部环境如：品种的更新、饲料结构变化、饮水质量的变化等。随着养殖规模扩大、养殖品种丰富、养殖设施化智能化等的变化，单纯的依赖于一双眼睛、一把剪刀行走于禽病诊疗的江湖已经万万不能。
新病不断发生、老病表现新变化。新城疫、禽流感、传支、法氏囊炎、支原体、大杆、白痢、伤寒、球虫、肉鸡腹水综合症、马立克、网状内皮组织增殖病、白血病等老病常年可见，其发病表现出一些新变化，如法氏囊、温和型流感、新城疫呈隐性、不典型性发生，新城疫的基因VII型、超强毒株的传染性法氏囊炎、高致病性禽流感的非典型发生，三大肿瘤性疾病的隐性发生，往往被忽视。肾传支、腺胃炎、病毒性关节炎、肿头综合症、传染性贫血、安卡拉病、包涵体肝炎、滑液囊支原体等新病时而出现。
混合感染、继发感染增多，有些鸡群甚至表现出病毒病和细菌病以及寄生虫病混合感染，一些条件性疾病和环境性疾病如大肠杆菌病、魏氏梭菌病、球虫病、支原体病等更加容易流行和发生，成为某些鸡场的必发性疾病。甚至出现慢性呼吸道综合症、肿头综合症、肠毒综合症、消化系统紊乱综合症、肝肾综合征等。临床常见的混合感染主要有：温和型流感+大肠杆菌+支原体（+鼻气管鸟杆菌+衣原体），新城疫+大杆+支原体，温和型流感+传支+支原体+大肠杆菌（+鼻气管鸟杆菌+衣原体），新城疫+肾传支传支，新城疫+传支+支原体，球虫+魏氏梭菌，球虫+魏氏梭菌+霉菌毒素（+革兰氏阴性肠道菌+蛔虫绦虫），包涵体肝炎+安卡拉病，霉菌毒素+弧菌型肝炎，霉菌毒素+包涵体肝炎，新城疫+法氏囊等。
病原体发生变异现象严重。由于疫苗的免疫加强、次数增多、剂量加大，且需要免疫的疾病种类增多，以及疫苗免疫的不规范化，使一些病原发生一定的变异，如流感、法氏囊、传支、马立克等血清型的变异。一些强毒株发生减弱现象如非典型的新城疫、H5N1的温和性变化；一些弱毒株发生增强现象，如基因VII新城疫，并出现一些超强毒株如超强的马立克、法氏囊毒株。
免疫抑制性病呈现广泛性存在，免疫抑制性因素非常普遍。如法氏囊炎、传染性贫血、腺胃炎、禽流感、网状内皮组织增殖病、马立克、白血病等不能得到有效地控制，造成鸡只的免疫器官发育受损、免疫缺陷、免疫力下降，增加防控难度。霉菌毒素引起的免疫抑制不亚于免疫抑制性疾病的危害。应激的频繁出现和应激因素的广泛存在是引起免疫抑制的重要因素。一些免疫抑制性药物的使用应引起注意，如激素类、磺胺类、氨基糖甙类、氯霉素类等药物应规范使用，尽量不用或少用这类药物。
细菌性病发病明显增多，大肠杆菌病、沙门氏菌病、葡萄球菌病、坏死性肠炎、支原体病的发生非常普遍。鼻气管鸟杆菌病的发生、传染性鼻炎、衣原体、滑液囊支原体的发生日渐增多。由于长期大量滥用抗菌素使得细菌抗药性增加，增加临床防治难度。细菌性疾病大多发生在病毒性疾病之后，原发病的诊治很重要。
